Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Prim1P20664 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prim1P20664 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prim1P20664 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prim1P20664 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prim1P20664 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prim1P20664 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prim1P20664 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prim1P20664 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prim1P20664 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prim1P20664 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prim1P20664 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prim1P20664 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prim1P20664 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms