Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxb9P20615 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxb9P20615 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb9P20615 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms