Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcer1aP20489 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcer1aP20489 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms