Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cxcl9P18340 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl9P18340 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl9P18340 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl9P18340 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms