Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ass1P16460 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ass1P16460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ass1P16460 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ass1P16460 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ass1P16460 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ass1P16460 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ass1P16460 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ass1P16460 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ass1P16460 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ass1P16460 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms