Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhoP15409 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhoP15409 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhoP15409 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhoP15409 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RhoP15409 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RhoP15409 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RhoP15409 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RhoP15409 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RhoP15409 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RhoP15409 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RhoP15409 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RhoP15409 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhoP15409 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhoP15409 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhoP15409 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhoP15409 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhoP15409 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhoP15409 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhoP15409 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhoP15409 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RhoP15409 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhoP15409 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhoP15409 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhoP15409 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhoP15409 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoP15409 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoP15409 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoP15409 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoP15409 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoP15409 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhoP15409 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RhoP15409 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhoP15409 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhoP15409 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhoP15409 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoP15409 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoP15409 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoP15409 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoP15409 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoP15409 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhoP15409 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoP15409 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoP15409 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoP15409 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoP15409 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhoP15409 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoP15409 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoP15409 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoP15409 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoP15409 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoP15409 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhoP15409 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoP15409 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoP15409 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhoP15409 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms