Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpsaP14206 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpsaP14206 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpsaP14206 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpsaP14206 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpsaP14206 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RpsaP14206 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RpsaP14206 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpsaP14206 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpsaP14206 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpsaP14206 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpsaP14206 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpsaP14206 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpsaP14206 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpsaP14206 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RpsaP14206 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RpsaP14206 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpsaP14206 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpsaP14206 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RpsaP14206 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RpsaP14206 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RpsaP14206 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RpsaP14206 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RpsaP14206 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RpsaP14206 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpsaP14206 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RpsaP14206 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RpsaP14206 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RpsaP14206 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RpsaP14206 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RpsaP14206 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpsaP14206 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpsaP14206 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpsaP14206 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpsaP14206 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RpsaP14206 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms