Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh3P13705 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msh3P13705 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msh3P13705 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh3P13705 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh3P13705 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh3P13705 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh3P13705 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh3P13705 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh3P13705 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms