Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd5P13379 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd5P13379 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd5P13379 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd5P13379 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd5P13379 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms