Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf4P11403 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fgf4P11403 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms