Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl2P10148 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl2P10148 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms