Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CatspereP0DP43 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CatspereP0DP43 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CatspereP0DP43 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms