Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Becn2P0DM65 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Becn2P0DM65 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Becn2P0DM65 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Becn2P0DM65 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms