Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Myl3P09542 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Myl3P09542 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl3P09542 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Myl3P09542 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl3P09542 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Myl3P09542 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl3P09542 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Myl3P09542 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myl3P09542 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl3P09542 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl3P09542 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl3P09542 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myl3P09542 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myl3P09542 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms