Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb1P09055 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1P09055 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1P09055 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms