Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd3P09027 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms