Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AfpP02772 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AfpP02772 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AfpP02772 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AfpP02772 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AfpP02772 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AfpP02772 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AfpP02772 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AfpP02772 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AfpP02772 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AfpP02772 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AfpP02772 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AfpP02772 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AfpP02772 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AfpP02772 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AfpP02772 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AfpP02772 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AfpP02772 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AfpP02772 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AfpP02772 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AfpP02772 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AfpP02772 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AfpP02772 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AfpP02772 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AfpP02772 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AfpP02772 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AfpP02772 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AfpP02772 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AfpP02772 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AfpP02772 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AfpP02772 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AfpP02772 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AfpP02772 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AfpP02772 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AfpP02772 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AfpP02772 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AfpP02772 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AfpP02772 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AfpP02772 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AfpP02772 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AfpP02772 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AfpP02772 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AfpP02772 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AfpP02772 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AfpP02772 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AfpP02772 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AfpP02772 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AfpP02772 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AfpP02772 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AfpP02772 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AfpP02772 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AfpP02772 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AfpP02772 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AfpP02772 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AfpP02772 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AfpP02772 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AfpP02772 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AfpP02772 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AfpP02772 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AfpP02772 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms