Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01811 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01811 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01811 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01811 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01811 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01811 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01811 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01811 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01811 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01811 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01811 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01811 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01811 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01811 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01811 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01811 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01811 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01811 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01811 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01811 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01811 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01811 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01811 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01811 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01811 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01811 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01811 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms