Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01797 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01797 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01797 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01797 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01797 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01797 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01797 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01797 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01797 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01797 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01797 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01797 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01797 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01797 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01797 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01797 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01797 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01797 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01797 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01797 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01797 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01797 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01797 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01797 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01797 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01797 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01797 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01797 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01797 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01797 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01797 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01797 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01797 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01797 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01797 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01797 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01797 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01797 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01797 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01797 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01797 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01797 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01797 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01797 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01797 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01797 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms