Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01679 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
P01679 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01679 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01679 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01679 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01679 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01679 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P01679 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01679 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P01679 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01679 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01679 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01679 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01679 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01679 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01679 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01679 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01679 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01679 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01679 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01679 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01679 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01679 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01679 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01679 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01679 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01679 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01679 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01679 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01679 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01679 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01679 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01679 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01679 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01679 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01679 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01679 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01679 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01679 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01679 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01679 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01679 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01679 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01679 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01679 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01679 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01679 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01679 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01679 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01679 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01679 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01679 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01679 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01679 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01679 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P01679 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01679 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01679 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01679 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01679 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01679 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01679 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01679 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01679 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01679 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01679 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01679 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01679 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01679 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01679 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01679 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms