Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odc1P00860 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odc1P00860 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Odc1P00860 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Odc1P00860 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odc1P00860 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odc1P00860 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odc1P00860 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odc1P00860 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odc1P00860 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odc1P00860 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Odc1P00860 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Odc1P00860 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms