Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl1O89112 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lancl1O89112 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lancl1O89112 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lancl1O89112 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms