Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn3O88990 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn3O88990 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Actn3O88990 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn3O88990 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Actn3O88990 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms