Protein–RNA interactions for Protein: O88967

Yme1l1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yme1l1O88967 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Yme1l1O88967 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yme1l1O88967 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yme1l1O88967 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yme1l1O88967 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms