Protein–RNA interactions for Protein: O88962

Cyp8b1, 7-alpha-hydroxycholest-4-en-3-one 12-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp8b1O88962 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp8b1O88962 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp8b1O88962 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp8b1O88962 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp8b1O88962 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp8b1O88962 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp8b1O88962 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms