Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Orc4O88708 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Orc4O88708 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Orc4O88708 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Orc4O88708 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Orc4O88708 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Orc4O88708 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Orc4O88708 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Orc4O88708 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Orc4O88708 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Orc4O88708 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Orc4O88708 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms