Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BlmO88700 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BlmO88700 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BlmO88700 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BlmO88700 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BlmO88700 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BlmO88700 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
BlmO88700 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BlmO88700 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BlmO88700 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BlmO88700 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BlmO88700 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BlmO88700 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BlmO88700 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BlmO88700 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BlmO88700 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BlmO88700 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BlmO88700 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BlmO88700 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BlmO88700 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BlmO88700 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BlmO88700 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BlmO88700 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BlmO88700 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BlmO88700 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BlmO88700 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BlmO88700 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
BlmO88700 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BlmO88700 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
BlmO88700 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
BlmO88700 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
BlmO88700 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
BlmO88700 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BlmO88700 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BlmO88700 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BlmO88700 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BlmO88700 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BlmO88700 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BlmO88700 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
BlmO88700 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BlmO88700 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BlmO88700 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BlmO88700 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BlmO88700 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BlmO88700 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BlmO88700 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BlmO88700 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BlmO88700 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BlmO88700 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BlmO88700 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
BlmO88700 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BlmO88700 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BlmO88700 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BlmO88700 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BlmO88700 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BlmO88700 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BlmO88700 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BlmO88700 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BlmO88700 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BlmO88700 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BlmO88700 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BlmO88700 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BlmO88700 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BlmO88700 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BlmO88700 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BlmO88700 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BlmO88700 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BlmO88700 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BlmO88700 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BlmO88700 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BlmO88700 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BlmO88700 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BlmO88700 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BlmO88700 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BlmO88700 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BlmO88700 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BlmO88700 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BlmO88700 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BlmO88700 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BlmO88700 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BlmO88700 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BlmO88700 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BlmO88700 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BlmO88700 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BlmO88700 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BlmO88700 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BlmO88700 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms