Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sorl1O88307 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sorl1O88307 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms