Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lnx1O70263 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lnx1O70263 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lnx1O70263 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms