Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja1O55176 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja1O55176 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja1O55176 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja1O55176 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja1O55176 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja1O55176 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja1O55176 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja1O55176 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja1O55176 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms