Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dsg2O55111 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dsg2O55111 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dsg2O55111 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms