Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap6O54834 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap6O54834 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arhgap6O54834 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap6O54834 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms