Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpibO35906 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpibO35906 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpibO35906 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SpibO35906 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SpibO35906 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SpibO35906 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SpibO35906 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SpibO35906 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpibO35906 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpibO35906 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpibO35906 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpibO35906 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpibO35906 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpibO35906 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpibO35906 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpibO35906 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpibO35906 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpibO35906 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpibO35906 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpibO35906 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpibO35906 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpibO35906 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpibO35906 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpibO35906 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpibO35906 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpibO35906 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpibO35906 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpibO35906 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpibO35906 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpibO35906 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpibO35906 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SpibO35906 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SpibO35906 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SpibO35906 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SpibO35906 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SpibO35906 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SpibO35906 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SpibO35906 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpibO35906 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpibO35906 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SpibO35906 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpibO35906 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpibO35906 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpibO35906 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SpibO35906 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SpibO35906 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpibO35906 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpibO35906 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpibO35906 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpibO35906 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpibO35906 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpibO35906 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpibO35906 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpibO35906 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpibO35906 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpibO35906 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpibO35906 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpibO35906 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpibO35906 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms