Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chil3O35744 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chil3O35744 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chil3O35744 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chil3O35744 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chil3O35744 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chil3O35744 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chil3O35744 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms