Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn6O35646 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn6O35646 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn6O35646 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn6O35646 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn6O35646 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn6O35646 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn6O35646 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn6O35646 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms