Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-ObO35424 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-ObO35424 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-ObO35424 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms