Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpsf2O35218 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf2O35218 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf2O35218 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms