Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe40O35185 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhe40O35185 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhe40O35185 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms