Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flot1O08917 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flot1O08917 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flot1O08917 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flot1O08917 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flot1O08917 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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