Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Eftud2O08810 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eftud2O08810 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms