Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Barx2O08686 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Barx2O08686 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Barx2O08686 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Barx2O08686 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Barx2O08686 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Barx2O08686 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Barx2O08686 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Barx2O08686 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Barx2O08686 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Barx2O08686 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Barx2O08686 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms