Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myh11O08638 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh11O08638 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh11O08638 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh11O08638 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh11O08638 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh11O08638 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh11O08638 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh11O08638 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh11O08638 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh11O08638 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh11O08638 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh11O08638 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms