Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rundc3aO08576 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc3aO08576 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3aO08576 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms