Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm8271L7N2E2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm8271L7N2E2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm8271L7N2E2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm8271L7N2E2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm8271L7N2E2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm8271L7N2E2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm8271L7N2E2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm8271L7N2E2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm8271L7N2E2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms