Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3542K7N6U2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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