Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11236J3QMS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm11236J3QMS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm11236J3QMS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm11236J3QMS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms