Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm3J3QMI4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calhm3J3QMI4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calhm3J3QMI4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calhm3J3QMI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calhm3J3QMI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calhm3J3QMI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calhm3J3QMI4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calhm3J3QMI4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms