Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf4bG5E8Z2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4bG5E8Z2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms