Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn20G5E8X0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn20G5E8X0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn20G5E8X0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn20G5E8X0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms