Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp17lcG5E8I7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lcG5E8I7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp17lcG5E8I7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lcG5E8I7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
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